The determination of some phenotypic and genotypic characteristics of group c streptococcus isolates from different sources

The aim of this study was the detection of group C streptococci in 115 isolates from the laboratory collection of Microbiology Department of the Veterinary Faculty, Selcuk University that had been collected from different sources and the determination of some of their phenotypic and genotypic characteristics. This included the evaluation of biofilm production, susceptibility to different antibiotics, detection of SZP virulence factor gene and the determination of sequence variation among strains and genotyping by RAPD method. Streptococcus equi subspecies zooepidemicus ATCC 35246 was used as a standard strain. In this study, 41 of the isolates were confirmed to be group C streptococci by using Latex Streptococcus grouping kit. The identification was completed by both biochemical and molecular methods. The whole strains were Streptococcus equi subspecies zooepidemicus. The biofilm formation was evaluated by three different methods (congo red agar, crystal violet staining method and SEM microscope). In spite of the slight incompatibility among the congo red agar and crystal violet staining methods the majority of isolates were confirmed as strongly biofilm producing strains. The testing of antimicrobial susceptibility revealed a relatively high sensitivity to five antibiotics and mild resistance to the sixth antibiotic. The virulent gene SZP was detected in 35 of the isolates including the reference strain ATCC 35246. The SZP sequence was confirmed to be variable among different strains after comparing all the sequences and generating the phylogenic tree. The genotyping by RAPD method revealed the high variability among strains and also similarity between some of them. In conclusion, group C streptococci originating from the horse respiratory system were found variable.

Bu çalışmanın amacı, farklı kaynaklardan toplanan Veteriner Fakültesi, Mikrobiyoloji Anabilim Dalı laboratuvar koleksiyonunda bulunan 115 izolatta C Streptococcus grubunun tespit edilmesi ve bazı fenotipik ve genotipik özelliklerinin belirlenmesidir. Bunlar, biyofilm üretiminin değerlendirilmesi, farklı antibiyotiklere duyarlılık, SZP virülans faktörü geninin tespiti ve suşlar arasında sekans varyasyonunun belirlenmesi ve RAPD metodu ile genotiplemedir. Standard suş olarak Streptococcus equi subspecies zooepidemicus ATCC 35246 suşu kullanıldı. Bu çalışmada, lateks Streptokok gruplama kiti kullanılarak izolatların 41'inin C grubu Streptokok olduğu doğrulandı. Tanımlama hem biyokimyasal hem de moleküler yöntemlerle yapıldı. Suşların tamamı Streptococcus equi subspecies zooepidemicus'du. Biyofilm oluşumu üç farklı yöntemle değerlendirildi (kongo kırmızı agar, kristal violet boyama yöntemi ve SEM mikroskobu). Kongo kırmızısı agar ve kristal violet boyama yöntemleri arasındaki düşük uyuşmazlığa rağmen, izolatların çoğunun kuvvetli biyofilm üreten suşlar olduğu doğrulandı. Antimikrobiyal duyarlılık testi, denenen antibiyotiklere nispeten yüksek duyarlılık ve bir ı antibiyotiğe hafif direnç gösterdi. Virülent gen SZP, ATCC 35246 referans suşu dahil izolatların 35'inde tespit edildi. SZP dizisinin, bütün dizileri karşılaştırdıktan ve filogenik ağacı oluşturduktan sonra farklı suşlar arasında değişkenlik olduğu doğrulandı. RAPD yöntemiyle genotiplendirme, suşlar arasındaki yüksek değişkenliği ve ayrıca bazıları arasındaki benzerliği ortaya koydu. At solunum sistemi kökenli C grubu streptokoklarda varyasyon olduğu kanaatine varıldı.