High-throughput genomic simple sequence repeat (SSR) marker development and construction of a high resolution physical map in button mushroom (Agaricus bisporus) genome

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorUncu, Ali Tevfik
dc.contributor.authorUncu, Ayşe Özgür
dc.date.accessioned2018-07-04T11:06:53Z
dc.date.accessioned2018-02-07
dc.date.available2018-07-04T11:06:53Z
dc.date.issued2018-04
dc.date.submitted2018-03-13
dc.description.abstractKültür mantarı [Agaricus bisporus (J.E. Lange) Imbach], bir model organizma olmasının yanı sıra dünya genelinde yetiştirilen bir yenilebilir mantar türüdür. Bilimsel ve ekonomik önemine rağmen A. bisporus genomuna özel moleküler markör geliştirme çalışmaları ancak yakın zamanda gerçekleştirilmeye başlanmış olup, oldukça kısıtlı sayıdadır. Bu çalışma kapsamında A. bisporus genomuna özel 3943 adet yeni basit dizi tekrarı (SSR) markörü geliştirilmiştir. Geliştirilen markörler A. bisporus kromozomlarına dengeli şekilde dağılmakta olup, genomun sekans-spesifik markörler ile doyurulmasını sağlamaktadır. Çalışma kapsamında tanıtılmakta olan yüksek sayıdaki A. bisporus’a özel yeni DNA markörü, bu türde gerçekleştirilecek moleküler genetik çalışmalar için kıymetli bir kaynak teşkil edecektir.en_US
dc.description.abstractButton mushroom [Agaricus bisporus (J.E. Lange) Imbach], is both a model organism and a worldwide cultivated edible mushroom species. Despite its scientific and economic relevance, efforts to develop molecular markers in A. bisporus genome are scarce and relatively recent. The present research reports the development of 3943 novel simple sequence repeat (SSR) markers specific to the A. bisporus genome. The marker set is well-distributed among the 13 A. bisporus chromosomes, saturating the entire genome with sequence-specific markers. The large number of novel, A. bisporus specific DNA markers introduced in the present work constitute a valuable resource for molecular genetic research in button mushroom, including strain identification and protection, and gene/QTL (Quantitative Trait Locus) mapping.en_US
dc.description.sponsorshipDOI:10.30708/mantar.391682en_US
dc.identifier.citationUncu, A. T., Uncu, A. Ö. (2018). High-throughput genomic simple sequence repeat (SSR) marker development and construction of a high resolution physical map in button mushroom (Agaricus bisporus) genome. Mantar Dergisi, 9, (1), 28-35. Retrieved from http://dergipark.gov.tr/mantar/issue/36725/391682en_US
dc.identifier.endpage35
dc.identifier.issn2147-6845en_US
dc.identifier.startpage28
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12395/11174
dc.identifier.volume9
dc.language.isoenen_US
dc.publisherSelçuk Üniversitesi, Mantarcılık Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğüen_US
dc.relation.ispartofMantar Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Kategori Belirleneceken_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.selcuk20240510_oaigen_US
dc.subjectMolecular geneticsen_US
dc.subjectBioinformaticsen_US
dc.subjectSequence-specific markersen_US
dc.subjectDNA markersen_US
dc.subjectMoleküler genetiken_US
dc.subjectBiyoinformatiken_US
dc.subjectDiziye özgü işaretçileren_US
dc.subjectDNA belirteçlerien_US
dc.titleHigh-throughput genomic simple sequence repeat (SSR) marker development and construction of a high resolution physical map in button mushroom (Agaricus bisporus) genomeen_US
dc.title.alternativeKültür mantarı (Agaricus bisporus) genomuna özel yüksek miktarda basit dizi tekrarı (SSR) markörünün geliştirilmesi ve yüksek çözünürlükte fiziksel genom haritasının oluşturulmasıen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Ali Tevfik Uncu, Ayse Ozgur Uncu.pdf
Boyut:
405.63 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.51 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Dergi Yayın Koleksiyonu